Le craniopharyngiome est une malformation tissulaire embryonnaire (c'est-à-dire apparue avant la naissance) de la région hypophysaire. Les raisons de cette malformation sont encore inconnues.

C’est une tumeur bénigne, c’est-à-dire non cancéreuse, souvent kystique, visible à l'IRM (Imagerie par Résonance Magnétique). Elle se développe à partir des restes de la poche de Rathke, dans et au-dessus de l'hypophyse. Elle peut entraîner principalement des maux de tête, des troubles de la vision et des déficits hormonaux (ralentissement de la croissance, prise de poids anormale, tendance à uriner et à boire beaucoup…).