The Virtual Brain Node 5 - 5ème training workshop

Marseille, France, 15 - 16 mai 2017.
Le workshop « The Virtual Brain Node 5 », est organisé à Marseille du 15 au 16 mai 2017

 

Cet atelier est consacré à la compréhension théorique et pratique de la modélisation des réseaux cérébraux à grande échelle en utilisant la plate-forme neuroinformatique ‘open source’ The Virtual Brain (TVB). Cet atelier se tiendra sur 2 jours avec des sessions pratiques de modélisation en utilisant des cas concrets comme l’étude de l'état de repos, et cliniques comme l’épilepsie et les accidents vasculaires cérébraux. C’est la première fois qu’une formation approfondie sur l’ajustement de ces modèles aux données d'imagerie médicale humaine est proposée aux étudiants et chercheurs.


TVB permet la modélisation biologiquement réaliste de la dynamique des réseaux neuronaux en utilisant une approche basée sur le connectome à travers différentes échelles cérébrales. Ces modèles de réseaux personnalisés peuvent être dérivés à partir des données IRM individuelles, sont configurables et génèrent des signaux macroscopiques de neuroimagerie, tels que les IRMf, les EEG stéréotaxiques et intracrâniens, ainsi que les EEG et MEG de surface de sujets individuels. Grâce au TVB, les chercheurs de différentes disciplines peuvent ainsi bénéficier d'une plateforme logicielle intégrative incluant un système de soutien pour la gestion des données (génération, organisation, stockage, intégration et partage) et un noyau de simulation écrit en Python.

 

Format du workshop: présentations et tutoriels pratiques. Les participants sont encouragés à apporter leurs propres données pour travailler.
Aperçu du programme du workshop :

 

  • Introduction théorique sur la modélisation des réseaux cérébraux à grande échelle
  • Architecture de The Virtual Brain
  • Interagir avec TVB en utilisant les interfaces GUI et Python
  • Prétraitement des données d'imagerie, ou comment obtenir un set de données TVB
  • Ajustement des paramètres des modèles aux données fonctionnelles
  • Modélisation des réseaux neuronaux à l'état de repos dans les IRMf
  • Modélisation d’un accident vasculaire cérébral et de sa récupération
  • Modélisation de l'épilepsie et des interventions chirurgicales
  • Modification du code TVB et implémentation de nouvelles fonctionnalités
  • Sessions pratiques avec vos propres données : prétraitement et simulations

 

Retrouvez le programme détaillé ainsi que les instructions sur la page officielle de l’événement.
Date limite d’inscription : 20 avril 2017
Pour toute question, veuillez contacter Viktor Sip (viktor.sip@univ-amu.fr).

 

Liens utiles :
http://epinext.org/
http://fr.ap-hm.fr/service/neurophysiologie-clinique-hopital-timone
http://fr.ap-hm.fr/sites/default/files/files/communiques-et-dossiers-de-presse/cp-cerveau-virtuel-cnrs_vf_1.pdf